В 1988 г. на инженерную службу РВСН была возложена задача по уничтожению ракет «Пионер» взрывным способом. Председателем комиссии по разработке технологии подрыва твердотопливных ракет назначается Лысов. В стране и мире такой технологии не было. Привлеченные к этой работе ученые дали отрицательное заключение на возможность взрыва твердотопливных ракет без остатка. Для этого были серьезные основания. Твердое топливо ракет должно было быстро гореть при пуске ракеты, не допуская детонации, т.е. взрыва. Но Лысов со своими офицерами продолжал опыты по подрыву ракет, которые в конечном счете завершились разработкой необходимой технологии.
До первого демонстрационного подрыва связки из трех ракет, назначенного на 28 августа 1988 г., оставалось менее двух недель. К условленному времени в Капустин Яр прибыли представители ООН из многих стран. Два американских полковника высказали категорическое сомнение Лысову, что взрыв будет произведен без остатков топлива и конструкции ракеты. Им был дан ответ: «Убедитесь на месте после взрыва». Прибывшие на место взрыва американцы тщательно обследовали поле подрыва и не нашли никаких остатков взорванных ракет.
Аналогичным способом Лысов с участием полковников Н.И. Кушко, Д.Ф. Жданова и офицеров службы организовал разработку технологии подрыва высокозащищенных шахт с извлечением металла дефицитных марок (в т.ч. корабельной стали) на поверхность.
В 1990 г. по инициативе промышленности появилась задача испытания новых ракетных комплексов на устойчивость их от ударной волны ядерного взрыва. В условиях запрета ядерных взрывов единственным способом испытать живучесть новых образцов вооружения оставался только подрыв обычного взрывчатого вещества большой мощности. Начальник инженерных войск МО СССР генерал-полковник В.П. Кузнецов принял решение выделить необходимое количество ВВ. Поставка 1 000 т тротила для заряда (операция «Сдвиг») была возложена на НИС РВСН, а прием – на НИС полигона подполковника А.Ф. Кашкарова. Когда 1 000 т ВВ было поставлено на полигон в Плесецк и заряд подготовлен к взрыву, пришел неожиданный запрет Генерального штаба на его производство. Оказалось, что руководство Архангельской области обратилось к Президенту СССР с просьбой запретить взрыв в виду его больших экологических последствий. От обратного приема ВВ Управление НИВ МО СССР отказалось из-за непригодности их для хранения. Предложено было взрывать ВВ партиями до 20 т. Генерал-майору Лысову удалось аргументировано убедить Главнокомандующего РВСН Героя Советского Союза генерала армии Ю.П. Максимова и членов Военного Совета в том, что взрывы по 20 т будут продолжаться почти год, по своему звуковому эффекту они мало будут отличаться от 1000-тонного, а, значит, в течение года будут держать в напряжении окружающее население. Экологической опасности 1000-тонного взрыва не существует. Главком убедил Генеральный штаб, разрешение на взрыв было получено. Взрыв мощностью 1 000 тонн тротилового эквивалента был произведен в 1991 г. Он явился первым взрывом такой мощности в мировой истории и подтвердил вывод об отсутствии экологических последствий. На месте взрыва образовалось небольшое озеро.
В 1994 г. генерал-майор Лысов был уволен в запас. В течение семи лет работал преподавателем тактики инженерных войск в ВИА, занятия проводил на различных факультетах. Одновременно восстановил свое членство в партии. Являлся членом ЦК и членом Московского областного комитета КПРФ. Участвовал в общественной работе, создании патриотического офицерского движения, избирался в его руководящие органы.

Длительное время является бессменным председателем садового кооператива ветеранов РВСН.
Виталий Парфенович заслуженно награжден орденами Красной Звезды, «За службу Родине в Вооруженных Силах СССР» 3 ст. и 22 медалями Советского Союза, Российской Федерации, Министерства обороны. Кроме того, он награжден различными орденами, медалями и знаками отличия общественных организаций. Среди них «Медаль имени Ю. Гагарина» за непосредственное участие в обеспечении выполнения Программ космических исследований СССР и знак, само название которого говорит о том, за что удостоен его обладатель – «За заслуги в ветеранском движении».